累進課税制度とは、課税所得が増えるほど高い税率が段階的に適用される仕組みです。所得税では「超過累進課税方式」が採用されており、所得全体に一律の税率をかけるのではなく、所得の各階層ごとに異なる税率を適用します。

本記事では、年収別のモデルケースを用いたシミュレーションを交えながら、所得税の累進課税制度の仕組みと計算手順をわかりやすく解説します。また、給与計算担当者が押さえておくべき源泉徴収・年末調整の流れや、計算ミスを防ぐ実務ポイントも紹介します。

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1. 累進課税制度とは

累進課税とは、所得や財産などの対象となる基準に応じて税率が段階的に上昇する仕組みです。

所得税における累進課税制度では、所得が増えるほど税率が高くなるよう設定されており、高所得者はより多くの税金を納めることになります。

1-1. なぜ累進課税制度がある？メリット・デメリットは？

所得税で累進課税制度が採用されている理由は、「所得の再分配」を目的としているためです。高所得者からより多くの税を徴収し、その財源をもとに社会保障・教育・福祉といった公共サービスを充実させることで、所得格差の是正を図ります。これにより、経済的な公平を保ち、社会の安定を維持する狙いがあるのです。

また、所得税は「応能負担（能力に応じた負担）」の原則に基づいており、生活に必要な最低限の所得には低い税率を、余裕のある所得には高い税率が適用されます。これにより、所得に応じた公平な税負担が実現され、低所得者の生活を過度に圧迫しない仕組みとなっています。

一方で、累進課税制度にはいくつかのデメリットもあります。例えば、高所得者ほど税率が高くなることで「働いても手取りが増えにくい」と感じ、労働意欲や投資意欲が低下する懸念もあります。さらに、国際的には税率の低い国へ移住する人が増え、優秀な人材の国外流出を招く可能性も指摘されています。

このような課題もあるため、累進課税制度は時代の変化や経済状況に合わせて見直しがおこなわれています。会社担当者であれば、最新の税制改正の動向を常に把握し、源泉徴収や年末調整など社内の運用体制を定期的に見直すことが重要です。

関連記事：給与計算における所得税の計算方法とは？源泉徴収の仕組みも解説

1-2. 累進課税制度で計算するもの

日本における累進課税制度の対象となる主な税金は、「所得税」「相続税」「贈与税」の3つです。所得税以外にも、富の再分配を通じて経済的な公平を保つことを目的として、相続税や贈与税にも累進課税が採用されています。

ただし、所得税のすべてが累進課税の対象となるわけではありません。例えば、株式の譲渡益や配当所得などは「分離課税」として一定の税率で課税され、他の所得と合算して累進課税を適用する仕組みにはなっていません。つまり、所得の種類や課税方法によって、累進課税の適用範囲が異なる点に留意する必要があります。

関連記事：所得税率は所得金額で変わる！税率改定の影響や注意すべきポイント

1-3. 単純累進課税と超過累進課税の違い

引用：所得税の税率構造｜財務省

累進課税には、税率の適用方法によって「単純累進課税」と「超過累進課税」の2種類があります。単純累進課税とは、所得全体にその人の所得階層に対応する税率を一律でかける方式です。例えば、所得が500万円で税率20％の階層に該当する場合、500万円全額に20％が適用され、税額は100万円となります。

一方の超過累進課税は、所得をいくつかの階層（区分）に分け、各階層ごとに異なる税率を適用する仕組みです。例えば「195万円未満は5％」「195〜330万円未満は10％」「330〜695万円未満は20％」といったように、所得が増えるにつれて段階的に高い税率がかかります。

日本では、この超過累進課税方式が採用されています。これは、所得のうち「増えた部分」にのみ高い税率がかかるため、所得が急に増えても税負担が極端に重くなることはありません。特に昇給や賞与支給時には、「所得税率の上昇＝損」ではなく、「一部の所得に高い税率が適用されるだけ」という点を丁寧に伝えることで、従業員の不安や誤解を防げます。

参考：No.2260 所得税の税率｜国税庁

2. 所得税の計算すべてが累進課税ではない？

具体的に、所得税における累進課税の対象になる税金にはどのようなものがあるのでしょうか。

所得の種類を解説したうえで、どの所得が累進課税制度の対象となるのか解説します。

2-1. 所得の種類

所得は性質によって、次の10種類に分けられます。

利子所得	お金の貸し借りによって得られる利子による所得のことを指します。預金や貸付金、債券、定期預金などから得られる利子が該当します。
配当所得	株式や出資によって得られる利益の一部であり、株式の配当金や投資信託の分配金などによって得られる利益が該当します。
不動産所得	不動産の賃貸収入や不動産の売却によって得られる利益を指します。
事業所得	事業活動によって得られる所得のことを指します。個人事業主やフリーランスなどがおこなう事業活動によって得られる収入や利益が該当します。
給与所得	雇用されて働くことによって得られる報酬や給与のことを指します。会社などの雇用主から、給与や賞与など賃金として支払われる収入を指します。
退職所得	労働者が会社を退職する際に、退職金や一時恩給などの形で受け取る収入が該当します。
山林所得	山林（森林）から得られる収入が該当します。 山林の所有者や管理者が、木材の伐採や林業に関連する活動によって得られる収入が山林所得となります。
譲渡所得	資産や財産を売却または譲渡することによって得られる収入が該当します。
一時所得	特定の事業や活動から一時的に得られる収入のことを指します。一時所得は、通常の給与所得や事業所得などの定期的な収入とは異なり、一定の期間や特定の出来事に関連して得られる収入が該当します。
雑所得	上記の所得分類に該当しないさまざまな種類の所得が該当します。

所得の種類によって課税方式や控除額が異なり、所得税の計算方法が変わってきます。正しく分類することが、適正な税額計算の第一歩となります。

関連記事：所得税計算の税率は？所得税計算の基礎や控除を解説！

2-2. 累進課税の対象になるもの／ならないもの

所得税の計算においては、すべての所得が累進課税の対象となるわけではありません。所得の性質によって、大きく「総合課税」として他の所得と合算し累進税率を適用するものと、「分離課税（一部を除く）」として一定の税率が適用されるものに区分されます。

【累進課税の対象となる所得】

次のような所得は、他の所得と合算して課税所得を算出し、累進税率に基づいて税額を計算します。

• 給与所得：会社員やアルバイトなどが得る給料・賞与
• 事業所得：個人事業主やフリーランスによる営業・業務の収入
• 不動産所得：アパートやマンションの賃貸などによる家賃収入
• 雑所得：公的年金や副業による収入など
• 一時所得：懸賞金、保険の満期金などの一時的な所得

なお、退職所得は分離課税の対象ではありますが、その計算にあたっては累進税率が用いられます。また、山林所得も分離課税に区分されますが、「5分5乗方式」という独自の計算方法が採用されている点が特徴です。

【累進課税の対象とならない所得】

一方、次のような所得は、他の所得と合算せずに「一定の税率」で課税されます。

• 預貯金や国債などから得られる利子
• 株式の配当金（※申告分離課税を選択した場合）
• 株式・土地・建物などの売却益　など

なお、利子所得や配当所得、譲渡所得には、総合課税と分離課税の対象になるものがあります。たとえば、上場株式の配当金については「総合課税」「申告分離課税」「確定申告不要」の3つの方式から選択でき、それぞれで課税の仕組みや税負担が異なるため注意が必要です。

参考：所得税計算の仕組み｜財務省

2-3. 所得税の税率一覧｜最高税率は45%

実際に国税庁のホームページに掲載されている所得税累進課税表では、次のとおり所得の税率は一部分離課税に対するものを除き、5％～45％の7段階に区分されています。つまり、最高税率は45%です。

課税所得金額	税率	控除額
1,000円から1,949,000円まで	5%	0円
1,950,000円から3,299,000円まで	10%	97,500円
3,300,000円から6,949,000円まで	20%	427,500円
6,950,000円から8,999,000円まで	23%	636,000円
9,000,000円から17,999,000円まで	33%	1,536,000円
18,000,000円から39,999,000円まで	40%	2,796,000円
40,000,000円以上	45%	4,796,000円

引用：No.2260 所得税の税率｜国税庁

平成25年から令和19年までは、所得税と復興特別所得税（その年の基準所得税額の2.1％）を併せて申告・納付することとなります。

「収入によって控除額が異なるため、覚えるのが大変」と感じている方も少なくないでしょう。当サイトでは、収入に応じた控除額や納付額の計算方法、給与計算をおこなううえで注意するポイントをわかりやすくまとめた資料を用意しています。給与や税金の計算をおこなうたびに調べている方向けの資料ですので、ぜひこちらからダウンロードしてご覧ください。

3 . 所得税の計算方法

所得税の計算は、一般的に次のような流れでおこなわれます。

1. 収入金額から必要経費を差し引き、所得金額を算出する
2. 所得金額から各種の所得控除を差し引き、課税所得金額を求める
3. 課税所得金額に税率を適用して、所得税額を計算する
4. 税額控除を差し引いて、基準となる所得税額を算出する
5. 基準所得税額に2.1％を乗じて、復興特別所得税額を加算する
6. 源泉徴収額や予定納税額を差し引き、最終的に納付すべき所得税額を確定する

参考：No.1000 所得税のしくみ｜国税庁

所得税を正しく計算するには、各種の所得金額を求めるだけでなく、所得控除や税額控除の内容を正確に理解しておくことが重要です。特に、年末調整で適用できる控除と、確定申告をしなければ適用できない控除があるため、それぞれの違いを把握しておくことが大切です。

関連記事：【2025年分】年末調整の計算方法を5ステップで解説！計算例も紹介

3-1. 所得控除（所得金額から差し引かれる金額）

所得控除とは、各納税者の控除の対象となる扶養親族が何人いるかなどの個人的事情を加味して、税負担を調整するものです。

【所得控除の種類】

• 雑損控除
• 医療費控除
• 社会保険料控除
• 小規模企業共済等掛金控除
• 生命保険料控除
• 地震保険料控除
• 寄附金控除
• 障害者控除
• 寡婦控除
• ひとり親控除
• 勤労学生控除
• 配偶者控除
• 配偶者特別控除
• 扶養控除
• 特定親族特別控除（※2025年分から適用が可能）
• 基礎控除

参考：No.1100 所得控除のあらまし｜国税庁

このうち、雑損控除・医療費控除・寄附金控除は、原則として確定申告でなければ適用できません。なお、ふるさと納税（寄附金控除）は、ワンストップ特例制度を活用すれば、確定申告をせずとも控除を適用できます。

そのため、年末調整担当者や人事労務担当者は、従業員に対して「どの控除が年末調整で適用でき、どの控除が確定申告で必要か」を正しく案内することが大切です。誤った理解のまま申告漏れや過剰控除が生じると、後の修正申告につながるおそれもあるので、丁寧な周知が求められます。

関連記事：所得控除とは？控除の種類や所得控除を受ける方法を解説

3-2. 税額控除（税金から差し引かれる金額）

税額控除とは、課税所得金額に税率を乗じて算出した所得税額から、一定の金額を控除するものです。

【主な税額控除の種類】

• 配当控除
• 外国税額控除
• 寄附金特別控除
• 住宅借入金等特別控除（住宅ローン控除）　など

参考：No.1200 税額控除｜国税庁

住宅ローン控除は1年目は確定申告が必要ですが、2年目以降であれば年末調整でも適用が可能です。その際、従業員は「住宅借入金等特別控除申告書」や「年末残高等証明書」を会社に提出する必要があるため、忘れずに準備してもらいましょう。

本章でも解説したように、所得控除・税額控除には複数の種類があったり、法改正で控除の種類が変わったりと、計算ミスが起きやすいので注意が必要です。

当サイトでは、上記のようなミスを防ぎつつ効率化をさせる方法や、そもそもとなる計算方法を解説した資料を無料で配布しております。

効率化の方法や基礎知識を確認したいご担当者様は、こちらから「所得・住民税 給与計算マニュアル」をダウンロードしてご確認ください。

3-3. 令和7年度税制改正による2025年分以降の所得税計算のポイント

令和7年度税制改正により、所得税について大きく次の4つの改正がおこなわれました。

• 基礎控除額の引き上げ
• 給与所得控除の最低保障額の引き上げ
• 特定親族特別控除の新設
• 扶養親族等の所得要件の緩和

基礎控除や給与所得控除の金額が引き上げられたことで、所得税が非課税となる範囲も拡大し、多くの人が所得税の負担が軽減されます。また、新しく特定親族特別控除が創設されたり、扶養親族等の所得要件が緩和されたりしたことで、所得控除を受けられる人やその金額が増える可能性があります。

これらの改正は2025年分の所得税計算から適用されます。源泉徴収や年末調整の仕組みを見直すことに加え、従業員の確定申告にも影響があることを周知しておくとよいでしょう。

参考：令和7年度税制改正による所得税の基礎控除の見直し等について｜国税庁

4. 所得税累進課税の具体的な年収別計算事例

ここでは、次の条件を設定したモデルケースをもとに、年収ごとの所得税額をシミュレーションします。

なお、これらの条件以外については基礎控除のみを適用し、その他の所得控除や税額控除は考慮せず、令和7年分の所得税制度に基づいて計算しています。

4-1. 年収300万円

まずは、給与所得の金額を計算します。給与所得は、給与収入から給与所得控除を差し引くことで求められます。

• 給与所得：202万円 = 年収：300万円 – 給与所得控除：98万円

次に、給与所得から基礎控除（88万円）、配偶者控除（38万円）、扶養控除（38万円）、社会保険料控除（50万円）を差し引き、課税所得を求めます。

• 課税所得：-12万円 = 給与所得：202万円 – 所得控除の合計：214万円

課税所得がマイナスとなる場合は、税法上は0円として取り扱われます。したがって、このケースでは所得税は課されません。また、給与から源泉徴収されていた所得税がある場合は、年末調整や確定申告によって全額還付されます。

4-2. 年収600万円

まずは、給与所得の金額を計算します。

• 給与所得：436万円 = 年収：600万円 – 給与所得控除：164万円

次に、給与所得から基礎控除（68万円）、配偶者控除（38万円）、扶養控除（38万円）、社会保険料控除（50万円）を差し引き、課税所得を求めます。

• 課税所得：242万円 = 給与所得：436万円 – 所得控除の合計：194万円

課税所得に応じた所得税の累進税率を適用して、所得税額を計算します。この際、国税庁が公表する「所得税の速算表」を活用すると計算がしやすくなります。

• 所得税額：14万4,500円 = 課税所得：242万円 × 所得税率：10％ – 9万7,500円

参考：No.2260 所得税の税率｜国税庁

今回は税額控除を適用しないので、この値が基準所得税額となります。基準所得税額に2.1%をかけることで、復興特別所得税額が計算できます。

• 復興特別所得税額：3,000円（100円未満切り捨て） = 基準所得税額：14万4,500円 × 2.1%

つまり、このケースでは、その年に納付すべき所得税および復興特別所得税は14万7,500円です。

4-3. 年収900万円

まずは、給与所得の金額を計算します。

• 給与所得：705万円 = 年収：900万円 – 給与所得控除：195万円（上限値）

次に、給与所得から基礎控除（58万円）、配偶者控除（38万円）、扶養控除（38万円）、社会保険料控除（50万円）を差し引き、課税所得を求めます。

• 課税所得：521万円 = 給与所得：705万円 – 所得控除の合計：184万円

課税所得に応じた所得税の累進税率を適用して、所得税額を計算します。

• 所得税額：61万4,500円 = 課税所得：521万円 × 所得税率：20％ – 42万7,500円

基準所得税額に2.1%をかけることで、復興特別所得税額が計算できます。

• 復興特別所得税額：1万2,900円（100円未満切り捨て） = 基準所得税額：61万4,500円 × 2.1%

つまり、このケースでは、その年に納付すべき所得税および復興特別所得税は62万7,400円です。

このように、年収が高くなるほど、給与所得控除の増加幅よりも収入の伸びのほうが大きくなるため、結果として課税所得が増加します。課税所得が増えると、累進課税制度により適用される税率も段階的に高くなり、最終的な所得税額も比例して大きくなります。

5. 従業員の所得税徴収から精算までの流れ

給与を支払う会社は、従業員の所得税を「源泉徴収」により毎月の給与などから天引きし、一定期間ごとに国に納付します。年末には、その年1年間の所得税額を再計算して過不足を精算する「年末調整」をおこない、最終的な税額を確定させます。ここでは、源泉徴収から精算までの基本的な流れを説明します。

5-1. 給与や賞与から源泉徴収をする

会社は、従業員に給与や賞与などを支払う際、支払金額や社会保険料、扶養親族等の人数などに応じて「源泉徴収税額表」に基づき所得税を差し引きます。差し引いた所得税は、原則として翌月10日までに所轄の税務署へ納付します。

期限を遅れて納付すると、不納付加算税や延滞税といった罰金の対象となる可能性があるため、期限内の納付が重要です。また、従業員に支給する退職金や、取引先に支払う報酬・料金なども、性質によっては源泉徴収の対象となります。

参考：令和7年版　源泉徴収のしかた｜国税庁

5-2. 年末調整をおこなう

会社には、年末調整をおこなう義務があります。年末調整は、1年間の給与支給が終了する12月に、従業員の年間所得税額を再計算し、毎月の源泉徴収額との過不足を調整する手続きです。これにより、源泉徴収で納めすぎていた場合は還付され、足りなかった場合は追加で徴収されます。

年末調整では、従業員から提出された申告書（扶養控除等申告書など）をもとに、各種控除を反映させて年税額を算出する必要があります。調整後は、1月末までに従業員へ源泉徴収票を交付し、税務署には法定調書を、市区町村には給与支払報告書を提出しなければなりません。

手続きを漏れなく進めるためには、年末調整のスケジュールを事前に設計することが重要です。具体的には、書類の提出期限や提出方法を従業員に周知し、回収後は社内で内容をチェックする体制を整えておくことが有効です。

関連記事：年末調整とは？【令和7年最新】確定申告との違いや必要書類、計算の流れをわかりやすく解説

5-3. 確定申告が必要な従業員もいる

年末調整は次のように対象外になる従業員もいます。

• 年の途中で退職した人（※一部は年末調整の対象となる場合があります）
• 扶養控除等申告書を提出していない人
• その年の給与収入が2,000万円を超える人
• 災害減免法に基づき所得税の源泉徴収について徴収猶予や還付を受けた人

参考：No.2665 年末調整の対象となる人｜国税庁

また、副業による所得が20万円を超える場合や、医療費控除・寄附金控除などを受けたい場合は、年末調整だけでは対応できません。その場合は確定申告が必要です。

確定申告の期間は、原則として翌年の2月16日から3月15日までです。追加で所得税を納付する必要があるにもかかわらず申告をおこなわなかった場合、従業員には無申告加算税や延滞税などのペナルティが課される可能性があります。対象となる従業員には、あらかじめ確定申告の案内をしておくことが望ましいでしょう。

関連記事：年末調整の対象者とは？必要書類や確定申告との関係も解説

6. 【会社担当者向け】所得税の累進課税に関して知っておきたいポイント

ここでは、会社担当者が知っておきたい所得税の累進課税に関する重要ポイントを、実務上の注意点も交えて詳しく紹介します。

6-1. 計算ミスにより大きく納税額が変わる可能性がある

所得税の累進課税制度では、所得が増えるにしたがって税率も段階的に高くなり、5％から45％まで設定されています。この仕組みにより、課税対象となる所得の計算に誤りがあると、本来支払うべき税額と大きく異なる金額が徴収される可能性があるのです。例えば、控除額の入力漏れや給与計算ソフトの設定ミスがある場合、従業員に対して過大または過少な源泉徴収がおこなわれるおそれがあります。

過大な源泉徴収が発生すると、従業員の手取り額が本来よりも少なくなり、生活設計に影響を与える可能性があります。一方、過少な源泉徴収がおこなわれると、年末調整や確定申告の際に不足分を徴収されることになり、従業員にとって予期せぬ負担となる場合もあるでしょう。

そのため、給与計算をおこなう際には、最新の税率表や扶養控除などの控除額の情報を常に確認することが不可欠です。また、給与計算ソフトを定期的に更新し、法改正や税制変更に対応しておくことが重要です。さらに、計算結果の二重チェックや、必要に応じて税理士など専門家への確認をおこなうことで、ミスを未然に防ぎ、従業員への影響を最小限に抑えられます。

関連記事：給与計算ミスへの対処法は？責任・リスクや防止策も解説！

6-2. 非課税所得（通勤手当や食事手当など）を覚えておく

所得税の計算において、すべての手当が課税対象になるわけではありません。一定条件を満たす通勤手当や出張旅費、食事補助などは「非課税所得」として扱われます。

例えば、電車やバスなどの交通機関を利用して通勤する従業員の通勤手当は「1ヵ月15万円」まで非課税です。また、会社が一部負担する食事代も一定の要件を満たし「月額3,500円以内（※令和8年度税制改正において拡充の要望が出されている）」であれば非課税となります。

参考：令和8年度税制改正要望（経済産業省）｜財務省

非課税所得の扱いを誤って課税所得に含めてしまうと、所得税の納税額が本来より高く計算されてしまう可能性があります。そのため、非課税所得の範囲や条件を正しく理解し、給与計算に反映させることが重要です。

令和7年11月20日の所得税法改正により、自動車や自転車などの交通用具で通勤する場合の非課税限度額が引き上げられました。この改正は令和7年4月1日以後に支払われる通勤手当へ遡って適用される点に注意が必要です。

参考：通勤手当の非課税限度額の改正について｜国税庁

通勤手当の非課税枠や年末調整での扱いについて詳しく知りたい方は、以下の記事もご覧ください。

関連記事：年末調整で通勤手当や交通費は給与に含まれる？非課税限度額や処理方法を解説

6-3. 所得税を抑える方法（ふるさと納税やiDeCoなど）を把握しておく

所得税は「収入」ではなく、各種所得控除を差し引いた後の「課税所得」に対して累進税率で計算されます。そのため、課税所得を減らすことで従業員の所得税負担を軽減できます。

例えば、基本給を単純に増やすと課税所得が増加するので所得税の負担も増えます。しかし、先ほど説明した法律で非課税と定められている手当（※上限や要件に注意）を活用すれば、課税対象にはならず、従業員への福利厚生を充実させながら税負担を増やさない運用が可能です。

また、ふるさと納税（寄附金控除）やiDeCo（小規模企業共済等掛金控除）を活用して所得控除を増やすことで、課税所得を下げ、所得税の負担をさらに軽減できます。ふるさと納税はワンストップ特例制度を使えば確定申告なしで控除が受けられます。iDeCoは掛金全額が控除対象で、将来の資産形成にもつながります。

従業員から所得税の計算方法や負担軽減の方法について質問があった場合、正確かつ具体的な情報を提供できれば、従業員の理解を深め、納得感を持って制度を利用してもらうことが可能です。また、こうした取り組みは従業員のエンゲージメント向上や職場満足度の向上にもつながるでしょう。

7. 所得税累進課税の計算をラクにおこなう方法

年末調整で所得税を計算する際は、従業員の所得に応じた累進課税の税率を適用させる必要があり、給与控除や所得控除、税額控除も加味したうえで、計算しなくてはなりません。

計算が煩雑であるうえに、従業員数が多い場合には作業量も膨大なものとなるでしょう。

年末調整に対応した給与システムであれば、手計算によるミスを減らし効率よく所得税の計算をおこなうことが可能です。所得控除や税額控除など従業員個人の控除を自動反映できるシステムであれば、経理担当者の年末調整時の負担も軽減できるでしょう。

所得税の計算業務の負荷が大きいと感じている事業者の方は、システム導入を検討してみるのも一つの手です。

関連記事：年末調整の電子化とは？やり方、企業におけるメリット・デメリットを解説

8. 累進課税制度は担税力を加味して公平性を保つための制度

所得税の累進課税制度は、所得が増えるほど高い税率が適用される仕組みです。日本では「超過累進課税方式」が採用されており、所得のうち高い部分にのみ高い税率がかかることで、税負担の公平性を保つことを目的としています。

所得税の計算では、まず収入から必要経費や各種の所得控除を差し引いて「課税所得」を算出し、その金額に応じて定められた税率を適用して税額を求めます。税率は5％から45％までの7段階で構成されています。

給与所得者の場合、毎月の給与から所得税が天引きされる「源泉徴収」がおこなわれ、年末には所得と控除額を基に正確な税額を算出する「年末調整」が実施されます。これらを正確・効率的におこなうには、最新の税制に対応した給与計算ソフトの導入が有効です。ソフトを活用すれば、計算ミスを防ぎ、事務負担を大幅に軽減できるでしょう。